秘鲁丛林是游戏中的首个开放区域，集主线剧情、古墓挑战与大量收集品于一体，探索前需优先制作弓箭作为基础工具，并建议获取探险家背包以在地图上显示关键地点位置。该区域的核心玩法围绕环境互动与物理机关解谜展开，初期需收集绳子、木材和羽毛制作弓箭，这是后续狩猎与破解机关的关键道具。推进主线时，常需与同伴合作推动机关或利用树枝摆荡至高台，部分区域需要后期获得开锁器、攀爬器等工具才能返回，因此探索时需留意可后续解锁的路径。完成该区域100%探索需收集包括文物、壁画、求生贮藏点在内的34项物品，其中一些如遗物六分仪位于隐蔽洞穴内，细致搜索主路径两侧是提高效率的关键。
区域内的解谜机制深度依赖水利机关、绳索箭矢及重量平衡的配合，精准操作与时机把握是通关难点。例如在桥梁谜题中，玩家需先爬上左侧塔顶启动水闸，随后与同伴合作推动机关将水流导入特定容器，并迅速用弓箭射击破损容器下方的绳圈以完成连接，整个过程具有限时性。在审判凝视古墓中，则需要利用推车机关，先将其拉到特定位置使卡住的石头升起，再用绳索箭矢连接石像与中央吊桥的绳索结构，步骤较为繁琐。类似的物理互动还包括转动刻有文字的石盘、利用水的流动冲刷障碍以及通过人体配重保持机关平衡，这些设计将环境互动与文明解码深度融合。
战斗遭遇主要包括野生动物与敌对势力，策略上优先推荐利用丛林植被进行隐蔽潜行，或使用弓箭在远距离解决目标。游戏强调生存的真实感，弓箭箭矢需要玩家收集材料制作，因此资源管理显得尤为重要。当遭遇不可避免的交火时，应充分利用周围的掩体进行移动射击，避免长时间停留一处而被包围。丛林环境本身也构成动态威胁，例如暴雨可能引发环境变化，而地面布置的绊网陷阱与坍塌地板在未学习特定技能前难以察觉，遇到地板坍塌时必须迅速反应跳跃至安全区域。
收集要素分布广泛，其中两个核心古墓挑战冥界之门和审判凝视提供独特奖励，破解后可提升技能等级。冥界之门需用绳索箭矢拉开木栏并破坏机关绳索，审判凝视则需操纵水位升降来破解石门机关。挑战任务如采花者要求收集悬挂于树枝高处的大本炮仔草，需通过连续跳跃不同树枝采摘；而拟椋鸟巢射落挑战的四个目标则分布在树冠层显眼位置。独石碑作为重要收集要素，破译后可在地图上显示一个稀有资源范围圈，但前提是劳拉的克丘亚知识需达到专业等级，这通常通过阅读散布各处的文献来提升。
